RF-4C의 ECM능력은 오랜기간동안 지속적으로 개량되어 왔습니다.여기에는 ALR-17,31,46,50,126 레이더 경보시스템이 장착되었습니다.
RF-4C후기형에는 레이더 경보리시버가 일반화 되었습니다. 또한 새로운 전자장비로 리튼 AN/ALQ-125전술전자정찰장비(TECREC)센서가 실시간전송을 위한 데이터링크장치와 연결되어 설치되었습니다. 이시스템은 페이브오닉스로 잘알려져있는 시스템입니다. 또한 몇몇 RF-4C에는 리어시글러 AN/ARN-101 디지털 모듈러항공전자시스템및 항법장비가 설치 되었습니다. 일부기종에는 시카고항공산업전자의 와이드앵글카메라시스템 (EWACS)를 장착합니다.
또 특별히 개조된 39대의 RF-4C에는 AN/AVQ-26 페이브텍포트를 장착할수 있었습니다.
그리고 1970년 약 20대의 RF-4C(18대 블록 40, 2대 블록41)에는 타월선로안테나가 장착된 ARN-92 LORAN-D 항법시스템을 장착할수 있도록 개조됩니다.
RF-4C는 동체가운데 G-139포트에 내장된 거대한 제네럴다이나믹스 HIAC-1 광범위 경사사진촬영 카메라 시스템(LOROP)을 장착합니다. 이 카메라는 원래 제네럴다이나믹스 /마틴 RB-57F에서 발전되었고 약 100마일이상 먼거리에서의 정밀한 사진촬영이 가능하도록 제작되었습니다.
이 LOROP장착 RF-4C의 일부는 동유럽과 북한을 상대로 정찰임무를 수행했었습니다.
그러나 이포트는 크기가 커서 RF-4C의 비행성능을 상당히 저하 시켰었습니다.
그후 약 24대의 RF-4C가 66인치 촛점길이 CAI KS-127A와 127F LOROP 카메라로 개조됩니다.