사실 이 F-4E는 베트남전쟁때문에 허겁지겁 만든것은 아니었습니다. 공군은 이미 F-4C를 채용하면서 기관포문제에 대해 우려를 나타냈고 또한 이것을 눈치챈 멕도넬사에서 기관포장착형 팬텀에대한 설계안을 공군에 제안한적이 있었습니다. 그때가 1961년 3월이었는데, 공군에서 그다지 주목받지는 못했습니다.
그러나 멕도넬사는 1964년 후반기에 기관포장착 팬텀에 대한 연구를 다시 시작하게 되었고 이것은 그전과 달리 공군이 관심을 갖기 시작합니다.
그리고 1965년 1월에 기관포탑재형 팬텀 F-4E 개발에대한 자금이 공급됩니다.