F-4J는 자동항모 착함유도능력을 보유하기 위해 AN/ASW-25 One-Way 데이터링크를 장착합니다.
그리고 기존의 F-4B 레이돔아래에 설치되었던 적외선 탐지 추척포트를 제거 합니다.
엔진을 제외한 기체외관에서 B형과의 차이점이라면 바로 이레이돔을 보면 알수가 있죠.
그러나 이기체는 생산이 지속되면서 지속적으로 개량이 됩니다.