F-4J는 최고 17900파운드의 출력을 자랑하는 J79-GE-10엔진 2기를 장착합니다.
이엔진의 애프터 버너는 기존기종과 다른 칠면조 깃털형 으로 되어있어 기존기종과 외형상 구분될수 있습니다.
그리고 이엔진은 연기를 최대한 억제한 J79-GE-10B엔진으로 개량됩니다.
F-4J는 기존기종보다 늘어난 무게와 하강속도 비율의 증가로 B형보다 더 강화된 착륙장치를 장착합니다.
그래서 보다커진 착함장치를 수용하기 위해 F-4C의 날개에서 처럼 날개부를 위아래로 상당히 부풀려야 했습니다.